Nhà phát triển chính của Assassin Creed Shadows đảm bảo cho người chơi rằng việc chọn một nhân vật chính sẽ không ảnh hưởng đáng kể đến trải nghiệm của họ. Trò chơi có hai nhân vật có thể chơi được: Naoe, một nữ Shinobi và Yasuke, một Samurai châu Phi lịch sử, người đã đưa ra cuộc thảo luận trước khi phát hành.
Mối quan tâm nảy sinh rằng việc tập trung vào một nhân vật có thể dẫn đến các yếu tố câu chuyện bị bỏ lỡ hoặc trò chơi. Giám đốc sáng tạo Jonathan Dumont đã giải quyết những mối quan tâm này, mô tả cách tiếp cận cân bằng của riêng mình: ông xen kẽ giữa Naoe và Yasuke, chơi vài giờ với một trước khi chuyển sang người kia.
Tuy nhiên, Dumont nhấn mạnh rằng người chơi không bị phạt vì ủng hộ một nhân vật duy nhất. Trong khi mỗi nhân vật chính tự hào có các chuỗi mở đầu và cốt truyện cá nhân duy nhất, thì câu chuyện cốt lõi thích nghi với sự lựa chọn của người chơi. Anh ấy khuyến khích người chơi chơi như một nhân vật ưa thích của họ:
"Tôi không tin rằng bạn sẽ bỏ lỡ nhiều. Nó phụ thuộc vào phong cách chơi của bạn. Bạn có thể thử nghiệm để xem trò chơi thích nghi với lựa chọn nhân vật của bạn như thế nào. Mỗi anh hùng có phần giới thiệu và nhiệm vụ dành riêng cho riêng họ, nhưng trải nghiệm cốt lõi Thích nghi.